CTNNB1 by DY

From Biolecture.org

β-catenin is a dual function protein, regulating the coordination of cell–cell adhesion and gene transcription. In humans, the CTNNB1 protein is encoded by the CTNNB1 gene

 

cDNA sequence

ATGGCTACTCAAGCTGATTTGATGGAGTTGGACATGGCCATGGAACCAGACAGAAAAGCGGCTGTTAGTCACTGGCAGCAACAGTCTTACCTGGACTCTGGAATCCATTCTGGTGCCACTACCACAGCTCCTTCTCTGAGTGGTAAAGGCAATCCTGAGGAAGAGGATGTGGATACCTCCCAAGTCCTGTATGAGTGGGAACAGGGATTTTCTCAGTCCTTCACTCAAGAACAAGTAGCTGATATTGATGGACAGTATGCAATGACTCGAGCTCAGAGGGTACGAGCTGCTATGTTCCCTGAGACATTAGATGAGGGCATGCAGATCCCATCTACACAGTTTGATGCTGCTCATCCCACTAATGTCCAGCGTTTGGCTGAACCATCACAGATGCTGAAACATGCAGTTGTAAACTTGATTAACTATCAAGATGATGCAGAACTTGCCACACGTGCAATCCCTGAACTGACAAAACTGCTAAATGACGAGGACCAGGTGGTGGTTAATAAGGCTGCAGTTATGGTCCATCAGCTTTCTAAAAAGGAAGCTTCCAGACACGCTATCATGCGTTCTCCTCAGATGGTGTCTGCTATTGTACGTACCATGCAGAATACAAATGATGTAGAAACAGCTCGTTGTACCGCTGGGACCTTGCATAACCTTTCCCATCATCGTGAGGGCTTACTGGCCATCTTTAAGTCTGGAGGCATTCCTGCCCTGGTGAAAATGCTTGGTTCACCAGTGGATTCTGTGTTGTTTTATGCCATTACAACTCTCCACAACCTTTTATTACATCAAGAAGGAGCTAAAATGGCAGTGCGTTTAGCTGGTGGGCTGCAGAAAATGGTTGCCTTGCTCAACAAAACAAATGTTAAATTCTTGGCTATTACGACAGACTGCCTTCAAATTTTAGCTTATGGCAACCAAGAAAGCAAGCTCATCATACTGGCTAGTGGTGGACCCCAAGCTTTAGTAAATATAATGAGGACCTATACTTACGAAAAACTACTGTGGACCACAAGCAGAGTGCTGAAGGTGCTATCTGTCTGCTCTAGTAATAAGCCGGCTATTGTAGAAGCTGGTGGAATGCAAGCTTTAGGACTTCACCTGACAGATCCAAGTCAACGTCTTGTTCAGAACTGTCTTTGGACTCTCAGGAATCTTTCAGATGCTGCAACTAAACAGGAAGGGATGGAAGGTCTCCTTGGGACTCTTGTTCAGCTTCTGGGTTCAGATGATATAAATGTGGTCACCTGTGCAGCTGGAATTCTTTCTAACCTCACTTGCAATAATTATAAGAACAAGATGATGGTCTGCCAAGTGGGTGGTATAGAGGCTCTTGTGCGTACTGTCCTTCGGGCTGGTGACAGGGAAGACATCACTGAGCCTGCCATCTGTGCTCTTCGTCATCTGACCAGCCGACACCAAGAAGCAGAGATGGCCCAGAATGCAGTTCGCCTTCACTATGGACTACCAGTTGTGGTTAAGCTCTTACACCCACCATCCCACTGGCCTCTGATAAAGGCTACTGTTGGATTGATTCGAAATCTTGCCCTTTGTCCCGCAAATCATGCACCTTTGCGTGAGCAGGGTGCCATTCCACGACTAGTTCAGTTGCTTGTTCGTGCACATCAGGATACCCAGCGCCGTACGTCCATGGGTGGGACACAGCAGCAATTTGTGGAGGGGGTCCGCATGGAAGAAATAGTTGAAGGTTGTACCGGAGCCCTTCACATCCTAGCTCGGGATGTTCACAACCGAATTGTTATCAGAGGACTAAATACCATTCCATTGTTTGTGCAGCTGCTTTATTCTCCCATTGAAAACATCCAAAGAGTAGCTGCAGGGGTCCTCTGTGAACTTGCTCAGGACAAGGAAGCTGCAGAAGCTATTGAAGCTGAGGGAGCCACAGCTCCTCTGACAGAGTTACTTCACTCTAGGAATGAAGGTGTGGCGACATATGCAGCTGCTGTTTTGTTCCGAATGTCTGAGGACAAGCCACAAGATTACAAGAAACGGCTTTCAGTTGAGCTGACCAGCTCTCTCTTCAGAACAGAGCCAATGGCTTGGAATGAGACTGCTGATCTTGGACTTGATATTGGTGCCCAGGGAGAACCCCTTGGATATCGCCAGGATGATCCTAGCTATCGTTCTTTTCACTCTGGTGGATATGGCCAGGATGCCTTGGGTATGGACCCCATGATGGAACATGAGATGGGTGGCCACCACCCTGGTGCTGACTATCCAGTTGATGGGCTGCCAGATCTGGGGCATGCCCAGGACCTCATGGATGGGCTGCCTCCAGGTGACAGCAATCAGCTGGCCTGGTTTGATACTGACCTGTAA

 

 

Amino Acid sequence

MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTSQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMG GHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL

'H' -> Helix, 'E' -> Extended, 'B' -> Buried, '-' -> other types

<code>MATQADLMELDMAMEPDRKAAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGKGNPEEEDVDTSQVLYEWEQGFSQSFTQEQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATRAIPELTKLLNDEDQVVVNKAAVMVHQLSKKEASRHAIMRSPQMVSAIVRTMQNTNDVETARCTAGTLHNLSHHREGLLAIFKSGGIPALVKMLGSPVDSVLFYAITTLHNLLLHQEGAKMAVRLAGGLQKMVALLNKTNVKFLAITTDCLQILAYGNQESKLIILASGGPQALVNIMRTYTYEKLLWTTSRVLKVLSVCSSNKPAIVEAGGMQALGLHLTDPSQRLVQNCLWTLRNLSDAATKQEGMEGLLGTLVQLLGSDDINVVTCAAGILSNLTCNNYKNKMMVCQVGGIEALVRTVLRAGDREDITEPAICALRHLTSRHQEAEMAQNAVRLHYGLPVVVKLLHPPSHWPLIKATVGLIRNLALCPANHAPLREQGAIPRLVQLLVRAHQDTQRRTSMGGTQQQFVEGVRMEEIVEGCTGALHILARDVHNRIVIRGLNTIPLFVQLLYSPIENIQRVAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSRNEGVATYAAAVLFRMSEDKPQDYKKRLSVELTSSLFRTEPMAWNETADLGLDIGAQGEPLGYRQDDPSYRSFHSGGYGQDALGMDPMMEHEMGGHHPGADYPVDGLPDLGHAQDLMDGLPPGDSNQLAWFDTDL
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