View source for HW1 - Predicting Protein Structure

<table border="0" cellpadding="2" style="width:100%">
	<tbody>
		<tr>
			<td>
			<table>
				<tbody>
					<tr>
						<td>Submitted Sequence in&nbsp;FASTA format</td>
					</tr>
				</tbody>
			</table>
			&nbsp;

			<table>
				<tbody>
					<tr>
						<td colspan="2">&gt;protein<br />
						MRLPAQLLGLLMLWVPGSSGDVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNTYLNW<br />
						FQQRPGQSPRRLIYRVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGLYYCMQHTHWS<br />
						PITFGQGTRLEIKR</td>
					</tr>
				</tbody>
			</table>
			</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&nbsp;
			<table>
				<tbody>
					<tr>
						<td>&nbsp;&nbsp;Predicted Secondary Structure</td>
					</tr>
				</tbody>
			</table>
			&nbsp;

			<table border="0">
				<tbody>
					<tr>
						<td><strong>Sequence</strong></td>
						<td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;20&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;40&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;80&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;120<br />
						&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br />
						MRLPAQLLGLLMLWVPGSSGDVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNTYLNWFQQRPGQSPRRLIYRVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGLYYCMQHTHWSPITFGQGTRLEIKR</td>
					</tr>
					<tr>
						<td><strong>Prediction</strong></td>
						<td>CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCSSSSCCCCCSSSCCCCCSSSSSSCCCCCCCCCCCCSSSSSCCCCCCCCSSSSSCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCSSSSSCCCCHHHCSSSSSSCCCCCCCCCCCCCCSSSSCC</td>
					</tr>
					<tr>
						<td><strong>Conf.Score</strong></td>
						<td>97258999999841689971077853187254489998898886787623578983578751398999707666143136889988232665887778888989758989865216999995237974875779</td>
					</tr>
					<tr>
						<td>&nbsp;</td>
						<td>H:Helix;&nbsp;S:Strand; C:Coil</td>
					</tr>
					<tr>
					</tr>
				</tbody>
			</table>
			</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&nbsp;
			<table>
				<tbody>
					<tr>
						<td>&nbsp;&nbsp;Predicted Solvent Accessibility</td>
					</tr>
				</tbody>
			</table>
			&nbsp;

			<table border="0">
				<tbody>
					<tr>
						<td><strong>Sequence</strong></td>
						<td>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;20&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;40&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;60&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;80&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;120<br />
						&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;|&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br />
						MRLPAQLLGLLMLWVPGSSGDVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNTYLNWFQQRPGQSPRRLIYRVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGLYYCMQHTHWSPITFGQGTRLEIKR</td>
					</tr>
					<tr>
						<td><strong>Prediction</strong></td>
						<td>75331313131210233341302011234414034634040403122213444443101011234643132002301436332033232333323230404423341202000103463313101432333348</td>
					</tr>
					<tr>
					</tr>
					<tr>
						<td>&nbsp;</td>
						<td>
						<p>Values range from&nbsp;<strong>0</strong>&nbsp;(buried residue) to&nbsp;<strong>9</strong>&nbsp;(highly exposed residue)</p>
						</td>
					</tr>
				</tbody>
			</table>

			<p>&nbsp;</p>

			<p>&nbsp;</p>

			<p>&nbsp;</p>

			<p><img alt="" src="/ckfinder/userfiles/images/thumbnail_model1.jpg" style="height:535px; width:535px" /></p>
			</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>